| Abstrak/Abstract |
Durian (Durio zibethinus Murr) kultivar Menoreh Kuning adalah
salah satu plasma nutfah Indonesia yang berasal dari Provinsi Daerah
Istimewa Yogyakarta. Pedagang durian umumnya menjual durian
dagangannya dengan mengakuinya sebagai Durian Menoreh. Oleh karena itu,
untuk mengidentifikasi kultivar Durian Menoreh tersebut diperlukan suatu
metode yang akurat, yaitu isolasi DNA sebagai langkah awal. Terdapat
beberapa metode isolasi DNA yaitu metode yang menggunakan detergen dan
kit komersial. Penelitian ini bertujuan untuk membandingkan profil total
DNA Durian Menoreh Kuning hasil isolasi dengan detergen dan kit komersial
(NucleonTM PhytopureTM Genomic DNA Extraction Kits) secara kualitatif dan
kuantitatif. Metode isolasi DNA dilakukan dengan detergen dan kit
komersial. Pelet DNA daun Durian Menoreh Kuning dilarutkan dalam 50 µL
TE kemudian masing-masing 5 µL sampel dielektroforesis dalam agarose 1%
selama 30 menit. Hasil elektroforesis kemudian di-staining dengan ethidium
bromide lalu diamati di bawah transluminator-UV. Hasil kedua metode
isolasi dibandingkan berdasarkan profil total DNA setelah dielektroforesis
dalam 1% agarose, berat pelet (total DNA), dan hasil Optical Density dari
DNA tersebut. Hasil penelitian menunjukkan bahwa DNA Durian Menoreh
Kuning yang diisolasi dengan detergen dan kit komersial dapat terlihat di
bawah transluminator-UV. Berat pelet DNA yang diisolasi dengan detergen
adalah 0,004 gram dan yang diisolasi dengan kit komersial adalah 0,0004
gram. Hasil OD untuk DNA yang diisolasi dengan detergen menunjukkan
nilai absorbansi 2,658 AU, rasio 1,057, konsentrasi 6645,6 µ gr/mL dan
protein 93,9 milligram/mL. Sedangkan hasil isolasi DNA dengan kit
komersial adalah 2,760 AU untuk absorbansi, rasio 1,339, konsentrasi 6900,6
µ gr/mL, dan protein 54,8 milligram/mL. Berdasarkan hasil penelitian dapat
diambil kesimpulan bahwa DNA Durian Menoreh Kuning dapat diisolasi
dengan detergen dan kit komersial. Profil DNA yang diisolasi dengan kit
komersial menunjukkan hasil yang lebih baik dibandingkan dengan profil
DNA yang diisolasi dengan detergen.
|
