Keragaman Genetik Gen Penyandi Dehydrogenase Sub-unit 3 Mitokondria pada Monyet Hantu (Tarsius sp.) (GENETIC DIVERSITY OF MITOCHONDRIAL DEHYDROGENASE SUB-UNIT 3 GENE ON TARSIUS SP.) (Rini Widayanti, Niken Satuti Nur Handayani, I Made Budiarsa)
Penulis/Author
Prof. Dr. Niken Satuti Nur Handayani, M.Sc. (2)
Tanggal/Date
2011
Kata Kunci/Keyword
Abstrak/Abstract
Tarsius merupakan salah satu satwa endemik Indonesia yang keberadaannya terancam punah. Upaya konservasi secara insitu dan exsitu pada satwa ini akan memperoleh hasil yang lebih sempurna apabila keragaman genetiknya diketahui dengan pasti. Tujuan penelitian ini adalah untuk mempelajari
keragaman genetik spesifik Tarsius sp.berdasarkan sekuen penyusun gen Dehydrogenase Sub-unit 3 (ND3). Sekuensing DNA menggunakan primer ND3 Forward dan ND3 Reverse menghasilkan sekuen 437 nt. Hasil sekuen fragmen ND3 dilakukan penjajaran berganda dengan primata lain yang diambil dari
Genebank menggunakan perangkat lunak Clustal W, dan selanjutnya dianalisis menggunakan MEGA versi 4.1. Satu situs nukleotida beragam (Simple nucleotide polymorphysm, SNP) didapatkan pada penelitian ini yaitu pada nukleotida nomor 24. Jarak genetik berdasarkan sekuen nukleotida ND3 menggunakan metode Kimura 2–parameter menghasilkan jarak genetik terkecil 0%, paling tinggi 0,03% dan rata-rata 0,01%. Konstruksi pohon filogenetik menggunakan metoda Neighbor joining tidak dapat membedakan antara T. dianae (asal Sulawesi Tengah), T. spectrum (asal Sulawesi Utara) dan T. bancanus (asal Lampung, Sumatera Selatan).
