| Abstrak/Abstract |
Genus Periophthalmus pada umumnya memiliki kemiripan morfologi yang dicirikan dengan bentuk tubuh yang menyerupai amphibi. Berdasarkan bentuk morfologi yang mirip antara jenis-jenis yang termasuk dalam genus Periophthalmus, maka kemungkinan besar banyak dijumpai cryptic species. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui karakterisasi genetik ikan Periophthalmus kalolo Lesson 1831 populasi muara Bogowonto berdasarkan gen mitokondria 16S. Penelitian karakterisasi genetik ikan P. kalolo ini adalah dengan mengamati variasi sekuens gen mitokondria 16S dan membandingkannya dengan data sekuens gen mitokondria 16S P. kalolo dari GenBank. Hasil penelitian menunjukkan bahwa dari 554 bp yang diamati dari empat sampel ikan P. kalolo yang diteliti memiliki jumlah tiga haplotipe. Haplotipe P. kalolo populasi Muara Bogowonto ini berbeda 1-5 bp. Hasil analisis dengan DnaSP menunjukkan bahwa keragaman haplotipe ikan P. kalolo adalah 0.83, sedangkan keragaman nukleotida adalah 0.0057. Berdasarkan analisis dengan menggunakan metode Kimura 2 Parameter (K2P) yang direkonstruksi dengan pohon filogeni Neighbor Joining tree dari MEGA7 terlihat ada dua clade pada spesies ikan P.kalolo, meskipun jarak genetik ikan P. kalolo populasi Bogowonto berkisar antara 0-0,2%. Namun jika dibandingkan dengan populasi ikan P. kalolo dari Sulawesi Utara (Kepulauan Bunaken, Kepulauan Mantehage, Sungai Bajo, dan Likupang) yang diambil dari data Genbank dengan accession number : JQ650380-JQ650384 dan KF273978-KF273981 memperlihatkan clade yang memisah diantara kedua group populasi tersebut. Hasil tersebut didukung oleh data jarak genetik yaitu 1,5%-2,2%. Hal ini memperlihatkan indikasi bahwa ikan P. kalolo di Indonesia adalah cryptic species. |
