Karya
Judul/Title Genetic Diversity and Phylogeny of Alocasia Longiloba Miq. Indonesia Accessions Based on trnL-F Intergenic Spacer Region
Penulis/Author Ni Putu Sri Asih (1) ; Prof. Dr. Purnomo, M.S. (2); Prof. Dr. Budi S. Daryono, M.Agr.Sc. (3)
Tanggal/Date 25 2023
Kata Kunci/Keyword
Abstrak/Abstract Alocasia longiloba Miq. termasuk dalam famili Araceae yang bersifat kompleks dan memiliki keragaman bentuk daun, warna, dan venasi. Studi keragaman A. longiloba sebagian besar hanya berdasarkan karakter morfologi, sedangkan untuk keragaman genetiknya belum pernah dilaporkan. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui keragaman genetik dan filogenetik A. longiloba aksesi Indonesia berdasarkan pendekatan molekuler pada region trnL-F IGS. Sebanyak 20 akses A. longiloba yang berasal dari Indonesia dan 11 sekuen DNA A. longiloba yang terdaftar di NCBI disekuensing kemudian disejajarkan dengan dengan software Mesquite. Keragaman genetic dianalisis dengan software DnaSP ver. 6.12.03. Pohon filogenetik direkonstruksi dengan MEGA 11 dengan metode Maximum Parsimony dan algoritma Tree-Bisection-Regrafting (TBR). Berdasarkan hasil, 389 area dianalisis, 356 area tidak bervariasi, 5 area bervariasi dan 28 area berupa gap. Keragaman genetik berupa insersi, delesi, transisi dan tranversi. Delesi menyumbang kontribusi terbesar dalam keragaman genetik A. longiloba. Rekontruksi pohon filogenetik menghasilkan A. longiloba bersifat polifiletik. Penggunaan cpDNA dengan wilayah trnL-F IGS tidak dapat menunjukkan hubungan antara A. longiloba aksesi Indonesia sehingga diperlukan penelitian lanjut pada daerah lain dalam DNA kloroplas dan inti.
Rumpun Ilmu Biologi (dan Bioteknologi Umum)
Bahasa Asli/Original Language English
Level Nasional
Status
Dokumen Karya
No Judul Tipe Dokumen Aksi
1GeneticDiversityandPhylogenyofAlocasialongilobaMiq_IndonesiaAccessionsbasedontrnL-FIntergenicSpacer.pdf[PAK] Full Dokumen