| Abstrak/Abstract |
Indonesia merupakan salah satu negara Mega Biodiversity dengan dua Biodiversity Hotspot (Sundaland dan Wallacea) yang terdiri dari 10% spesies tumbuhan (dari yang telah diketahui di dunia), 12% mamalia, 16% reptil dan amphibi, 17% burung, serta 25% ikan. Persentase jumlah spesies tersebut akan meningkat seiring dengan kemajuan penelitian molekular yang dapat mengidentifikasi suatu spesies secara lebih akurat. Salah satu gen mitokondria yang telah banyak digunakan untuk proses identifikasi ikan terutama pada kasus cryptic spesies dan karakterisasi morfologi yang ambigu yaitu gen mitokondria COI (cytochrome oxydase subunit I). Namun demikian, banyak ikan di Indonesia yang belum teridentifikasi secara akurat dan benar, salah satunya jenis ikan anggota Famili Blenniidae yang umumnya disebut ikan rockskipper. Ikan rockskipper memiliki kemiripan morfologi yang tinggi satu dengan lainnya, sehingga sering salah dalam penamaan spesiesnya dan hal ini akan berdampak pada usaha konservasi maupun pemuliaan ikan rockskipper. Oleh karena itu tujuan penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi spesies ikan rockskipper anggota famili Blennidae yang dikoleksi dari Pantai Porok, Gunungkidul, Yogyakarta menggunakan gen mitokondria COI sebagai DNA barcoding. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode PCR dengan menggunakan primer FishF2 dan FishR2.Tahap yang dilakukan meliputi pengambilan sampel, isolasi DNA, amplifikasi DNA, purifikasi DNA dan sekuensing yang dilanjutkan dengan analisis data menggunakan software DNASTAR, BLAST, MESQUITE, MEGA, DnaSP dan NETWORK. Software tersebut digunakan untuk identifikasi spesies, analisis variasi sekuen gen COI dan haplotype networking pada ikan rocskipper. Penelitian ini diharapkan dapat digunakan untuk menyusun pustaka gen COI ikan rockskipper di Indonesia dan dapat dijadikan sebagai acuan dalam konservasi maupun pemanfaatan dan pengelolaan ikan rockskipper secara baik dan berkesinambungan serta memberikan kontribusi pada pelestarian kekayaan biota air tawar di Indonesia.
|
