| Judul/Title |
DNA Barcode, Keragaman Genetik, dan Struktur Populasi Ikan Glodok, Periophthalmodon schlosseri (Pallas, 1770), dari Pantai Bahak Indah, Probolinggo, Jawa Timur |
| Abstrak/Abstract |
Salah satu ikan yang termasuk dalam kelompok mudskipper adalah Periophthalmodon schlosseri. Spesies ikan glodok ini memiliki potensi ekonomi untuk dikembangkan sebagai ikan hias dan obat tradisional. Selain itu ikan P.schlosseri merupakan salah satu ikan yang berperan penting dalam ekosistem mangrove. Namun demikian penelitian identifikasi menggunakan DNA barcode, keragaman genetik, dan struktur populasi ikan P.schlosseri di Indonesia masih sangat terbatas. Oleh karena itu penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi dan menganalisis keragaman genetik serta mendeteksi struktur populasi ikan P.schlosseri di Kawasan Hutan Mangrove Pantai Bahak Indah, Probolinggo, Jawa Timur menggunakan penanda molekuler gen mitokondra 16S rRNA. Metode yang digunakan dalam penelitian ini adalah metode PCR dengan menggunakan primer universal 16Sar (forward) dan 16Sbr (reverse).Tahap yang dilakukan meliputi pengambilan sampel, isolasi DNA, amplifikasi DNA, purifikasi DNA dan sekuensing yang dilanjutkan dengan analisis data menggunakan program DNASTAR, BLAST, MESQUITE, MEGA, BEAST, DnaSP, NETWORK, dan GENALEX. Program-program tersebut digunakan untuk identifikasi dan rekonstruksi pohon filogenetik serta analisis variasi genetik, haplotype networking, dan struktur populasi ikan P.schlosseri. Penelitian ini diharapkan dapat digunakan untuk menyusun pustaka gen 16S rRNA ikan P.schlosseri di Indonesia dan dapat dijadikan sebagai acuan dalam konservasi maupun pemanfaatan dan pengelolaan ikan P.schlosseri secara baik dan berkesinambungan. |
